La desinfección UV es un método de desinfección eficaz para inactivar microorganismos por la exposición de estos a las longitudes de onda que emiten, lo cual los hace incapaces de reproducirse.

La longitud de onda óptima para que la luz UV actúe como germicida e inactive los microorganismos se encuentra entre los 200-300 nm, principalmente a 254 nm es que el ADN y el ARN absorben esta energía y se ven perjudicados los ácidos nucleicos. Además, que se puede aprovechar como oxidante y destruir contaminantes químicos como lo son los pesticidas.

Uno de los puntos importantes a tener en cuenta para estos sistemas es que el diseño del sistema sea capaz de suplir una dosis suficiente para el caudal y que el daño celular no sea capaz de repararse.